D’une superficie de 3572 hectares, Plougonver se situe dans le canton de Belle-Isle-en-terre et compte une centaine de villages ou lieudits.

Plusieurs rivières agrémentent la commune. Le Léguer est la plus importante.

Dominé par le Ménez-Kerespers (321m) et tout proche du Ménez-Quénécador (314m), le relief de Plougonver est vallonné et boisé.

Plougonver présente des caractéristiques géologiques riches. Le sud-ouest, occupé par le massif granitique de Quintin, contient du schiste, présent dans les constructions de l’habitat ancien. Le nord-ouest est occupé par le massif granitique de Plouaret. Ces deux massifs datent de 330 millions d’années. Le centre se caractérise enfin par un sol fertile, d’origine sédimentaire d’environ 660 millions d’années.